Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr5P51682 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccr5P51682 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms