Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RorcP51450 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RorcP51450 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RorcP51450 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RorcP51450 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RorcP51450 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RorcP51450 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RorcP51450 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RorcP51450 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RorcP51450 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RorcP51450 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RorcP51450 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RorcP51450 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RorcP51450 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RorcP51450 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RorcP51450 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RorcP51450 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RorcP51450 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RorcP51450 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RorcP51450 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RorcP51450 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RorcP51450 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RorcP51450 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RorcP51450 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RorcP51450 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RorcP51450 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RorcP51450 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RorcP51450 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RorcP51450 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RorcP51450 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RorcP51450 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RorcP51450 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RorcP51450 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RorcP51450 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RorcP51450 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RorcP51450 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RorcP51450 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RorcP51450 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RorcP51450 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RorcP51450 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RorcP51450 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RorcP51450 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RorcP51450 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RorcP51450 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RorcP51450 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RorcP51450 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RorcP51450 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RorcP51450 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RorcP51450 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RorcP51450 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms