Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrp3P50462 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrp3P50462 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms