Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tnni3P48787 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnni3P48787 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnni3P48787 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnni3P48787 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnni3P48787 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnni3P48787 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms