Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl11P48298 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl11P48298 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms