Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax9P47242 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax9P47242 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pax9P47242 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax9P47242 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax9P47242 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax9P47242 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax9P47242 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms