Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NodalP43021 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NodalP43021 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NodalP43021 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NodalP43021 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NodalP43021 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NodalP43021 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NodalP43021 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NodalP43021 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NodalP43021 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NodalP43021 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NodalP43021 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NodalP43021 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NodalP43021 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NodalP43021 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NodalP43021 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NodalP43021 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NodalP43021 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NodalP43021 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NodalP43021 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NodalP43021 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NodalP43021 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NodalP43021 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NodalP43021 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NodalP43021 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NodalP43021 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NodalP43021 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NodalP43021 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NodalP43021 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NodalP43021 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NodalP43021 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NodalP43021 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NodalP43021 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NodalP43021 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NodalP43021 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NodalP43021 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NodalP43021 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NodalP43021 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NodalP43021 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NodalP43021 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms