Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx1-2P42580 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms