Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rfc1P35601 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rfc1P35601 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms