Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprmP28828 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprmP28828 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprmP28828 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprmP28828 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprmP28828 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprmP28828 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprmP28828 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprmP28828 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprmP28828 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprmP28828 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
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