Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NapbP28663 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NapbP28663 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NapbP28663 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NapbP28663 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NapbP28663 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NapbP28663 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NapbP28663 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NapbP28663 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NapbP28663 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NapbP28663 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NapbP28663 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NapbP28663 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NapbP28663 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NapbP28663 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NapbP28663 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NapbP28663 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NapbP28663 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NapbP28663 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NapbP28663 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NapbP28663 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NapbP28663 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NapbP28663 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NapbP28663 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NapbP28663 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NapbP28663 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NapbP28663 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NapbP28663 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NapbP28663 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NapbP28663 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NapbP28663 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NapbP28663 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NapbP28663 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NapbP28663 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NapbP28663 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NapbP28663 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NapbP28663 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NapbP28663 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NapbP28663 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NapbP28663 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NapbP28663 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NapbP28663 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NapbP28663 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NapbP28663 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NapbP28663 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NapbP28663 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NapbP28663 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NapbP28663 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NapbP28663 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NapbP28663 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NapbP28663 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NapbP28663 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NapbP28663 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NapbP28663 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NapbP28663 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NapbP28663 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NapbP28663 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NapbP28663 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NapbP28663 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NapbP28663 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NapbP28663 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NapbP28663 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NapbP28663 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NapbP28663 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NapbP28663 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NapbP28663 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NapbP28663 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NapbP28663 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NapbP28663 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NapbP28663 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NapbP28663 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NapbP28663 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NapbP28663 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NapbP28663 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NapbP28663 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NapbP28663 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NapbP28663 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NapbP28663 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NapbP28663 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NapbP28663 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NapbP28663 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NapbP28663 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NapbP28663 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NapbP28663 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NapbP28663 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms