Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apex1P28352 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apex1P28352 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apex1P28352 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms