Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gria1P23818 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gria1P23818 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gria1P23818 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gria1P23818 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gria1P23818 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gria1P23818 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gria1P23818 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms