Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou5f1P20263 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou5f1P20263 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms