Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps6ka3P18654 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps6ka3P18654 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms