Protein–RNA interactions for Protein: P18531

Ighv3-6, Ig heavy chain V region 3-6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-6P18531 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ighv3-6P18531 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv3-6P18531 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv3-6P18531 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv3-6P18531 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv3-6P18531 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv3-6P18531 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv3-6P18531 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv3-6P18531 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv3-6P18531 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv3-6P18531 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv3-6P18531 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv3-6P18531 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ighv3-6P18531 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ighv3-6P18531 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms