Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra6P16305 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms