Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rag1P15919 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rag1P15919 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rag1P15919 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rag1P15919 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rag1P15919 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rag1P15919 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rag1P15919 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms