Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf4P11403 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms