Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P10404 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P10404 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P10404 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P10404 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P10404 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P10404 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P10404 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P10404 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P10404 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P10404 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P10404 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P10404 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P10404 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P10404 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P10404 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P10404 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P10404 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P10404 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P10404 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P10404 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P10404 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P10404 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P10404 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P10404 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P10404 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P10404 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P10404 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P10404 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P10404 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P10404 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P10404 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P10404 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P10404 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P10404 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P10404 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P10404 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P10404 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P10404 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P10404 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms