Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abl1P00520 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abl1P00520 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abl1P00520 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abl1P00520 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abl1P00520 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abl1P00520 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Abl1P00520 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abl1P00520 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl1P00520 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl1P00520 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abl1P00520 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abl1P00520 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abl1P00520 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abl1P00520 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abl1P00520 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abl1P00520 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abl1P00520 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abl1P00520 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms