Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt1O88346 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.7 ms