Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RngttO55236 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RngttO55236 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RngttO55236 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RngttO55236 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RngttO55236 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RngttO55236 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RngttO55236 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RngttO55236 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RngttO55236 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RngttO55236 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RngttO55236 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RngttO55236 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RngttO55236 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RngttO55236 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RngttO55236 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RngttO55236 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RngttO55236 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RngttO55236 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RngttO55236 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RngttO55236 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RngttO55236 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RngttO55236 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RngttO55236 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RngttO55236 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RngttO55236 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RngttO55236 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RngttO55236 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RngttO55236 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RngttO55236 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RngttO55236 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RngttO55236 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RngttO55236 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RngttO55236 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RngttO55236 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RngttO55236 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RngttO55236 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RngttO55236 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RngttO55236 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RngttO55236 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RngttO55236 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RngttO55236 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RngttO55236 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RngttO55236 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RngttO55236 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RngttO55236 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RngttO55236 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RngttO55236 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RngttO55236 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RngttO55236 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RngttO55236 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RngttO55236 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RngttO55236 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RngttO55236 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RngttO55236 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RngttO55236 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RngttO55236 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RngttO55236 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RngttO55236 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RngttO55236 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RngttO55236 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RngttO55236 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RngttO55236 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RngttO55236 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RngttO55236 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RngttO55236 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RngttO55236 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RngttO55236 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RngttO55236 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RngttO55236 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RngttO55236 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RngttO55236 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RngttO55236 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RngttO55236 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RngttO55236 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RngttO55236 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RngttO55236 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RngttO55236 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RngttO55236 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RngttO55236 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RngttO55236 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RngttO55236 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms