Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FiglaO55208 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FiglaO55208 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FiglaO55208 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FiglaO55208 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FiglaO55208 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FiglaO55208 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FiglaO55208 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FiglaO55208 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FiglaO55208 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FiglaO55208 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FiglaO55208 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FiglaO55208 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FiglaO55208 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FiglaO55208 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms