Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp2a2O55143 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Atp2a2O55143 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp2a2O55143 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms