Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp10O55123 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp10O55123 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms