Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarce1O54941 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarce1O54941 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarce1O54941 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms