Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb3O54890 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb3O54890 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms