Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klrk1O54709 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klrk1O54709 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms