Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr6O54689 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms