Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf9O35739 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf9O35739 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf9O35739 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf9O35739 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf9O35739 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms