Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PnnO35691 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PnnO35691 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PnnO35691 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PnnO35691 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PnnO35691 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnnO35691 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnnO35691 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnnO35691 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnnO35691 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnnO35691 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnnO35691 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnnO35691 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnnO35691 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnnO35691 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnnO35691 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PnnO35691 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PnnO35691 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PnnO35691 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PnnO35691 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PnnO35691 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PnnO35691 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PnnO35691 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PnnO35691 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PnnO35691 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PnnO35691 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PnnO35691 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PnnO35691 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PnnO35691 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PnnO35691 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PnnO35691 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PnnO35691 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PnnO35691 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PnnO35691 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PnnO35691 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PnnO35691 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PnnO35691 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnnO35691 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnnO35691 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnnO35691 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnnO35691 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnnO35691 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnnO35691 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnnO35691 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnnO35691 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnnO35691 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnnO35691 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnnO35691 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PnnO35691 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PnnO35691 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PnnO35691 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PnnO35691 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PnnO35691 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PnnO35691 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PnnO35691 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PnnO35691 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PnnO35691 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PnnO35691 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PnnO35691 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PnnO35691 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PnnO35691 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PnnO35691 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PnnO35691 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PnnO35691 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PnnO35691 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PnnO35691 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PnnO35691 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PnnO35691 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PnnO35691 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PnnO35691 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PnnO35691 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PnnO35691 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PnnO35691 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PnnO35691 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PnnO35691 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PnnO35691 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PnnO35691 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PnnO35691 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PnnO35691 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PnnO35691 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PnnO35691 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PnnO35691 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PnnO35691 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PnnO35691 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms