Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20918J3QN17 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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