Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20708H3BKF4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20708H3BKF4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms