Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r12G5E8G1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms