Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmigd3G3X8R9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmigd3G3X8R9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms