Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ercc6F8VPZ5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ercc6F8VPZ5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms