Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf165E9QAU8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms