Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
BC005561E9Q5E2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BC005561E9Q5E2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms