Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NebE9Q1W3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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