Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fndc1E9Q043 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Fndc1E9Q043 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fndc1E9Q043 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fndc1E9Q043 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms