Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E430018J23RikE9PZQ8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E430018J23RikE9PZQ8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms