Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd2E9PZM4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chd2E9PZM4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Chd2E9PZM4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms