Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rsf1E9PWW9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rsf1E9PWW9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.73
Rsf1E9PWW9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rsf1E9PWW9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rsf1E9PWW9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms