Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gimd1E9PW74 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gimd1E9PW74 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gimd1E9PW74 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gimd1E9PW74 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gimd1E9PW74 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gimd1E9PW74 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gimd1E9PW74 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gimd1E9PW74 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gimd1E9PW74 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gimd1E9PW74 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gimd1E9PW74 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gimd1E9PW74 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms