Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms