Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc78D3Z5T1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc78D3Z5T1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc78D3Z5T1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc78D3Z5T1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc78D3Z5T1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc78D3Z5T1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc78D3Z5T1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc78D3Z5T1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc78D3Z5T1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc78D3Z5T1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc78D3Z5T1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms