Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc6D3YZP9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc6D3YZP9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms