Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SafbD3YXK2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SafbD3YXK2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms