Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc13D3YV10 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms